Protein–RNA interactions for Protein: Q5JU00

TCTE1, T-complex-associated testis-expressed protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTE1Q5JU00 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCTE1Q5JU00 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCTE1Q5JU00 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms