Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 PLEKHG2-203ENST00000425673 8132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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VAMP3Q15836 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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VAMP3Q15836 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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