Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
LAMB3Q13751 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms