Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms