Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.261e-8■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.311e-8■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.311e-8■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 CCPG1-208ENST00000568372 3388 ntTSL 1 (best)6.71□□□□□ -1.344e-16■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.514e-16■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 CCPG1-210ENST00000568592 702 ntTSL 34.18□□□□□ -1.744e-16■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 CCPG1-209ENST00000568543 721 ntTSL 34.18□□□□□ -1.744e-16■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.94e-16■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 CTNNB1-212ENST00000471014 607 ntTSL 315.72■□□□□ 0.116e-10■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.096e-10■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.266e-10■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 CTNNB1-203ENST00000396185 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.336e-10■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 FSCN1-205ENST00000473330 2215 ntTSL 222.34■■□□□ 1.179e-11■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.569e-11■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 ENY2-203ENST00000517350 2150 ntTSL 1 (best)14.73□□□□□ -0.052e-28■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.752e-6■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.682e-6■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.12e-6■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.352e-6■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.918e-12■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.398e-12■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 HSP90B1-203ENST00000548462 3032 ntTSL 212.88□□□□□ -0.358e-12■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 AURKA-204ENST00000395907 1902 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.862e-15■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.124e-7■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 PPP1R12A-203ENST00000450142 5721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.424e-7■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.73e-6■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 TRAPPC2L-210ENST00000565309 699 ntTSL 315.5■□□□□ 0.074e-7■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 RACK1-232ENST00000514318 581 ntTSL 319.87■□□□□ 0.771e-82■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.075e-8■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.242e-6■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 CDK16-220ENST00000523344 1266 ntTSL 514.43□□□□□ -0.12e-6■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 CDK16-203ENST00000428400 3016 ntTSL 213.26□□□□□ -0.292e-6■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 AES-204ENST00000585782 505 ntTSL 217.73■□□□□ 0.433e-19■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 AES-205ENST00000586003 367 ntTSL 217.26■□□□□ 0.353e-19■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.226e-11■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.096e-11■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.016e-11■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 NDUFB9-205ENST00000518657 672 ntTSL 29.15□□□□□ -0.946e-11■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.695e-8■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.343e-10■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.862e-9■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 ALDOC-202ENST00000395319 1519 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.112e-9■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 ALDOC-203ENST00000395321 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.292e-9■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.997e-8■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.147e-8■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.077e-12■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 SNHG5-204ENST00000425170 489 ntTSL 27.93□□□□□ -1.141e-12■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 BSDC1-201ENST00000341071 4599 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.122e-13■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 BSDC1-206ENST00000455895 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.242e-13■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 BSDC1-204ENST00000444377 2925 ntTSL 1 (best)11.93□□□□□ -0.52e-13■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 NUP188-201ENST00000372577 5689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.569e-7■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.588e-7■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 HNRNPM-205ENST00000596295 910 ntTSL 321.62■■□□□ 1.051e-10■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 EIF3E-218ENST00000523674 1072 ntTSL 26.1□□□□□ -1.431e-8■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.321e-23■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.651e-23■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 UBB-207ENST00000578649 477 ntTSL 515.62■□□□□ 0.091e-23■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 UBB-202ENST00000395837 1014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.481e-23■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 UBB-209ENST00000614404 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.631e-23■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 UBB-204ENST00000535788 704 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.651e-23■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 KHSRP-202ENST00000594496 999 ntTSL 222.07■■□□□ 1.123e-7■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 CDK16-214ENST00000520141 498 ntTSL 315.94■□□□□ 0.142e-6■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.482e-12■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.482e-12■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.472e-12■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 PARVB-206ENST00000477438 421 ntTSL 512.55□□□□□ -0.42e-12■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.452e-6■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.052e-18■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 PSMG1-203ENST00000411828 959 ntTSL 324.1■■□□□ 1.452e-18■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.382e-18■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 PSMG1-204ENST00000431628 760 ntTSL 1 (best)20.66■□□□□ 0.92e-18■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 OAZ1-209ENST00000592787 857 ntTSL 219.52■□□□□ 0.721e-34■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 CCND3-221ENST00000514588 490 ntTSL 429.42■■■□□ 2.32e-10■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 22e-10■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.712e-10■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 ARFGAP2-227ENST00000533243 1558 ntTSL 223.76■■□□□ 1.392e-10■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.272e-10■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 CCND3-212ENST00000510058 926 ntTSL 222.94■■□□□ 1.262e-10■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 JAG2-203ENST00000546616 2275 ntTSL 522.54■■□□□ 1.22e-10■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.182e-10■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 CCND3-209ENST00000505884 592 ntTSL 422.03■■□□□ 1.122e-10■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 CCND3-211ENST00000508143 574 ntTSL 422.03■■□□□ 1.122e-10■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 CCND3-214ENST00000511161 579 ntTSL 422.03■■□□□ 1.122e-10■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 CCND3-219ENST00000513956 562 ntTSL 222.03■■□□□ 1.122e-10■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 CCND3-208ENST00000505672 932 ntTSL 221.88■■□□□ 1.092e-10■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 COMMD4-213ENST00000565834 1671 ntTSL 521.4■■□□□ 1.022e-10■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.862e-10■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 WBP2-211ENST00000589642 568 ntTSL 319.09■□□□□ 0.652e-10■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 CCND3-206ENST00000502771 544 ntTSL 418.37■□□□□ 0.532e-10■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.512e-10■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 CRADD-212ENST00000609189 772 ntTSL 517.96■□□□□ 0.472e-10■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.42e-10■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 CRADD-209ENST00000551065 1293 ntTSL 216.97■□□□□ 0.312e-10■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 WBP2-214ENST00000590450 573 ntTSL 416.93■□□□□ 0.32e-10■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.232e-10■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 CCND3-220ENST00000514382 476 ntTSL 416.47■□□□□ 0.232e-10■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 HNRNPUL1-213ENST00000599614 2447 ntTSL 516.36■□□□□ 0.212e-10■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 WBP2-202ENST00000416574 987 ntTSL 215.77■□□□□ 0.122e-10■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.12e-10■■□□□ 11.8
PABPC4Q13310 ARFGAP2-201ENST00000395449 1772 ntTSL 515.41■□□□□ 0.062e-10■■□□□ 11.8
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