Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms