Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
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TWF1Q12792 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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TWF1Q12792 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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TWF1Q12792 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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TWF1Q12792 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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