Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms