Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms