Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms