Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms