Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGAM1P18669 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms