Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB3O43889 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB3O43889 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB3O43889 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB3O43889 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB3O43889 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB3O43889 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB3O43889 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB3O43889 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB3O43889 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB3O43889 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB3O43889 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB3O43889 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB3O43889 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB3O43889 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB3O43889 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB3O43889 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB3O43889 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB3O43889 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB3O43889 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB3O43889 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB3O43889 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB3O43889 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB3O43889 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB3O43889 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB3O43889 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB3O43889 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB3O43889 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB3O43889 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB3O43889 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB3O43889 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB3O43889 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB3O43889 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB3O43889 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB3O43889 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB3O43889 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB3O43889 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB3O43889 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB3O43889 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB3O43889 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB3O43889 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB3O43889 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB3O43889 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB3O43889 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CREB3O43889 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CREB3O43889 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CREB3O43889 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CREB3O43889 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CREB3O43889 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CREB3O43889 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CREB3O43889 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CREB3O43889 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CREB3O43889 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CREB3O43889 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CREB3O43889 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CREB3O43889 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CREB3O43889 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CREB3O43889 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms