Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRG3Q9Y2Y8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms