Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLCO1B3Q9NPD5 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms