Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRACR2AQ9BSW2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms