Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 ESPL1-205ENST00000552462 6447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms