Protein–RNA interactions for Protein: Q96J02

ITCH, E3 ubiquitin-protein ligase Itchy homolog, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITCHQ96J02 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITCHQ96J02 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms