Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC7

TMCO6, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO6Q96DC7 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCO6Q96DC7 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms