Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms