Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms