Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms