Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF2Q15853 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF2Q15853 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF2Q15853 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF2Q15853 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF2Q15853 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF2Q15853 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF2Q15853 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF2Q15853 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF2Q15853 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
USF2Q15853 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF2Q15853 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF2Q15853 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF2Q15853 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
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