Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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