Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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EFNB3Q15768 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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EFNB3Q15768 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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EFNB3Q15768 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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EFNB3Q15768 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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EFNB3Q15768 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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EFNB3Q15768 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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EFNB3Q15768 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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EFNB3Q15768 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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EFNB3Q15768 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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