Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCEA2Q15560 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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