Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms