Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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BRD3Q15059 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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BRD3Q15059 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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BRD3Q15059 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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BRD3Q15059 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
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BRD3Q15059 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
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BRD3Q15059 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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