Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms