Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 HSDL1-205ENST00000565275 533 ntTSL 26.53□□□□□ -1.362e-14■■□□□ 11.9
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PABPC4Q13310 DNAJC5-202ENST00000470551 5287 ntTSL 215.6■□□□□ 0.091e-6■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 ATP5I-204ENST00000515116 247 ntTSL 26.05□□□□□ -1.448e-19■■□□□ 11.9
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PABPC4Q13310 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.222e-6■■□□□ 11.9
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PABPC4Q13310 SLC2A1-203ENST00000426263 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.278e-14■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 PRELID1-204ENST00000503853 608 ntTSL 210.86□□□□□ -0.671e-9■■□□□ 11.9
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PABPC4Q13310 SET-204ENST00000372692 2850 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.541e-7■■□□□ 11.9
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PABPC4Q13310 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.823e-8■■□□□ 11.9
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PABPC4Q13310 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.145e-7■■□□□ 11.9
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PABPC4Q13310 TMEM205-214ENST00000591677 628 ntTSL 220■□□□□ 0.791e-8■■□□□ 11.9
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PABPC4Q13310 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.541e-8■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.511e-8■■□□□ 11.9
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PABPC4Q13310 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.181e-8■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.091e-8■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.071e-8■■□□□ 11.9
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PABPC4Q13310 TLK1-205ENST00000431350 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.071e-8■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 C16orf62-214ENST00000542027 1841 ntTSL 514.58□□□□□ -0.081e-8■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 C16orf62-223ENST00000566850 1016 ntTSL 214.03□□□□□ -0.161e-8■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.244e-6■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 ZER1-201ENST00000291900 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.241e-8■■□□□ 11.9
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PABPC4Q13310 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.291e-8■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 TLK1-201ENST00000359766 4321 ntTSL 512.37□□□□□ -0.431e-8■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 C16orf62-201ENST00000251143 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.431e-8■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 AZI2-212ENST00000479665 4706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.474e-6■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 C16orf62-203ENST00000438132 3855 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.491e-8■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 CCPG1-201ENST00000310958 6822 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.54e-16■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 LIG3-216ENST00000593099 4664 ntTSL 211.3□□□□□ -0.61e-8■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 SIN3A-201ENST00000360439 5050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.661e-8■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 CCPG1-212ENST00000569205 2970 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.854e-16■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 LIG3-202ENST00000378526 8400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.981e-8■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 AZI2-201ENST00000295748 3127 ntTSL 1 (best)8.19□□□□□ -1.14e-6■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 NDUFAB1-204ENST00000567761 520 ntTSL 37.99□□□□□ -1.131e-8■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 AZI2-206ENST00000429369 439 ntTSL 37.91□□□□□ -1.144e-6■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 CCPG1-211ENST00000568808 2866 ntTSL 1 (best)7.41□□□□□ -1.224e-16■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.244e-16■■□□□ 11.9
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