Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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PRKAA1Q13131 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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PRKAA1Q13131 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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PRKAA1Q13131 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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