Protein–RNA interactions for Protein: Q01459

CTBS, Di-N-acetylchitobiase, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBSQ01459 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTBSQ01459 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTBSQ01459 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTBSQ01459 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTBSQ01459 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTBSQ01459 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTBSQ01459 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTBSQ01459 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTBSQ01459 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTBSQ01459 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTBSQ01459 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTBSQ01459 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBSQ01459 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms