Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIM1P81133 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms