Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms