Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPGP40121 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPGP40121 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPGP40121 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPGP40121 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPGP40121 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPGP40121 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPGP40121 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPGP40121 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPGP40121 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPGP40121 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPGP40121 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPGP40121 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPGP40121 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPGP40121 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPGP40121 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPGP40121 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPGP40121 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms