Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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CASQ1P31415 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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CASQ1P31415 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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CASQ1P31415 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
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CASQ1P31415 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
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CASQ1P31415 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
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CASQ1P31415 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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