Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms