Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODC1P11926 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODC1P11926 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODC1P11926 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODC1P11926 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODC1P11926 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODC1P11926 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODC1P11926 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODC1P11926 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODC1P11926 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODC1P11926 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODC1P11926 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODC1P11926 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODC1P11926 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODC1P11926 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODC1P11926 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODC1P11926 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODC1P11926 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODC1P11926 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODC1P11926 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODC1P11926 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODC1P11926 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODC1P11926 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODC1P11926 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODC1P11926 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODC1P11926 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODC1P11926 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODC1P11926 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODC1P11926 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODC1P11926 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODC1P11926 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODC1P11926 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODC1P11926 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODC1P11926 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODC1P11926 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODC1P11926 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODC1P11926 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODC1P11926 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODC1P11926 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODC1P11926 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODC1P11926 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODC1P11926 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODC1P11926 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODC1P11926 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODC1P11926 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODC1P11926 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODC1P11926 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODC1P11926 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODC1P11926 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODC1P11926 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ODC1P11926 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODC1P11926 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODC1P11926 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODC1P11926 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODC1P11926 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODC1P11926 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODC1P11926 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODC1P11926 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODC1P11926 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODC1P11926 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODC1P11926 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODC1P11926 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODC1P11926 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODC1P11926 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODC1P11926 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms