Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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FAM58BPP0C7Q3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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FAM58BPP0C7Q3 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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FAM58BPP0C7Q3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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FAM58BPP0C7Q3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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FAM58BPP0C7Q3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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