Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
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PDE6DO43924 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PDE6DO43924 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PDE6DO43924 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PDE6DO43924 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PDE6DO43924 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PDE6DO43924 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PDE6DO43924 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PDE6DO43924 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PDE6DO43924 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PDE6DO43924 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PDE6DO43924 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PDE6DO43924 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDE6DO43924 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDE6DO43924 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDE6DO43924 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDE6DO43924 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDE6DO43924 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDE6DO43924 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDE6DO43924 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDE6DO43924 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDE6DO43924 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDE6DO43924 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDE6DO43924 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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PDE6DO43924 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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PDE6DO43924 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDE6DO43924 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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PDE6DO43924 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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PDE6DO43924 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDE6DO43924 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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PDE6DO43924 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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PDE6DO43924 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDE6DO43924 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDE6DO43924 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDE6DO43924 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDE6DO43924 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDE6DO43924 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDE6DO43924 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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