Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT52Q9Y366 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms