Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms