Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.05■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.05■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.05■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms