Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms