Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms