Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7R0

NANOGP1, Putative homeobox protein NANOG2, humanhuman

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP1Q8N7R0 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NANOGP1Q8N7R0 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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