Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms