Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MTMR3Q13615 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms