Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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