Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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